Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKAB1Q9Y478 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKAB1Q9Y478 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms