Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HCN4Q9Y3Q4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms