Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNIP3Q9Y2W7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP3Q9Y2W7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms