Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNNQ9UQP3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNQ9UQP3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNQ9UQP3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms