Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
L1RE1Q9UN81 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
L1RE1Q9UN81 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
L1RE1Q9UN81 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms