Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ADAM28Q9UKQ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ADAM28Q9UKQ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms