Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSRAQ9UJ68 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MSRAQ9UJ68 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms