Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBK1Q9UHD2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBK1Q9UHD2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms