Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTRF1LQ9UGC7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTRF1LQ9UGC7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTRF1LQ9UGC7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms