Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCMF1Q9P0J7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCMF1Q9P0J7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCMF1Q9P0J7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms