Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHBDL2Q9NX52 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDL2Q9NX52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms