Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMEM248Q9NWD8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms