Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC39A9Q9NUM3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC39A9Q9NUM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC39A9Q9NUM3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms