Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.76■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RRP7BPQ9NSQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7BPQ9NSQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms