Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRKQ9NRH2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRKQ9NRH2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms