Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CD163L1Q9NR16 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CD163L1Q9NR16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 549.9 ms