Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD93Q9NPY3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD93Q9NPY3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms