Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM138Q9NPI0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM138Q9NPI0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms