Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNMB3Q9NPA1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNMB3Q9NPA1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms