Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVK-5Q9HDB9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVK-5Q9HDB9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms