Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBF4

ZFYVE1, Zinc finger FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE1Q9HBF4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFYVE1Q9HBF4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE1Q9HBF4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms