Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A6

LRRC40, Leucine-rich repeat-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC40Q9H9A6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC40Q9H9A6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC40Q9H9A6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms