Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2LQ9H987 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2LQ9H987 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2LQ9H987 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2LQ9H987 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2LQ9H987 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNPO2LQ9H987 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNPO2LQ9H987 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPO2LQ9H987 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms