Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP13A3Q9H7F0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP13A3Q9H7F0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms