Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C11orf49Q9H6J7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C11orf49Q9H6J7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms