Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIF1Q9H611 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIF1Q9H611 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PIF1Q9H611 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PIF1Q9H611 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIF1Q9H611 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIF1Q9H611 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIF1Q9H611 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PIF1Q9H611 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIF1Q9H611 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIF1Q9H611 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIF1Q9H611 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIF1Q9H611 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIF1Q9H611 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIF1Q9H611 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIF1Q9H611 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms