Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA4AQ9H3S1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA4AQ9H3S1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms