Protein–RNA interactions for Protein: Q9H361

PABPC3, Polyadenylate-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC3Q9H361 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PABPC3Q9H361 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PABPC3Q9H361 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms