Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LHX5Q9H2C1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LHX5Q9H2C1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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