Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SDCBP2Q9H190 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDCBP2Q9H190 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms