Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMG9Q9H0W8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG9Q9H0W8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG9Q9H0W8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
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