Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZMYND12Q9H0C1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZMYND12Q9H0C1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms