Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXD1Q9GZZ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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HOXD1Q9GZZ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HOXD1Q9GZZ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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