Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN1Q9GZU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN1Q9GZU1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN1Q9GZU1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN1Q9GZU1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN1Q9GZU1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN1Q9GZU1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCOLN1Q9GZU1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCOLN1Q9GZU1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCOLN1Q9GZU1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms