Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR1EQ9GZS1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1EQ9GZS1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms