Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLR2J2Q9GZM3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms