Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CIPCQ9C0C6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CIPCQ9C0C6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms