Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC2Q9C0B9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms