Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT23Q9C075 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT23Q9C075 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms