Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM31Q9BZY9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM31Q9BZY9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms