Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDEM3Q9BZQ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms