Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM54Q9BYV2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms