Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM79Q9BSE2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms