Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC50A1Q9BRV3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC50A1Q9BRV3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms