Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDF4Q9BRK5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SDF4Q9BRK5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms