Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KLHDC3Q9BQ90 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHDC3Q9BQ90 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHDC3Q9BQ90 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms