Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TREX2Q9BQ50 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TREX2Q9BQ50 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms