Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTRQ99707 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTRQ99707 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTRQ99707 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRQ99707 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRQ99707 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRQ99707 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTRQ99707 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTRQ99707 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTRQ99707 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRQ99707 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRQ99707 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRQ99707 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRQ99707 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRQ99707 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRQ99707 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTRQ99707 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTRQ99707 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTRQ99707 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTRQ99707 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms