Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA3Q99618 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDCA3Q99618 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA3Q99618 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDCA3Q99618 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA3Q99618 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA3Q99618 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA3Q99618 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA3Q99618 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA3Q99618 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDCA3Q99618 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms