Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POP1Q99575 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POP1Q99575 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP1Q99575 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP1Q99575 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP1Q99575 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POP1Q99575 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POP1Q99575 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POP1Q99575 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP1Q99575 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP1Q99575 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP1Q99575 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP1Q99575 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP1Q99575 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP1Q99575 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP1Q99575 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POP1Q99575 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POP1Q99575 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP1Q99575 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP1Q99575 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP1Q99575 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP1Q99575 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP1Q99575 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POP1Q99575 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POP1Q99575 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POP1Q99575 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP1Q99575 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP1Q99575 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP1Q99575 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP1Q99575 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP1Q99575 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POP1Q99575 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms